Zuzana Fungáčová on väitellyt taloustieteiden tohtoriksi Center for Economic Research and Graduate Education (CERGE-EI) instituutissa Prahassa. Hänen väitöskirjansa aiheena oli yksityistämisen vaikutus osakemarkkinoiden kehitykseen siirtymätalouksissa. Lisäksi hänellä on taloustieteiden maisterintutkinto CERGE-EI:stä ja kauppatieteiden maisterintutkinto Bratislavan kauppakorkeakoulusta, Slovakiasta.
Zuzana Fungáčová on toiminut ekonomistina Suomen Pankin siirtymätalouksien tutkimuslaitoksessa syyskuusta 2007 lähtien. Hänen erityisalaansa ovat Venäjän pankki- ja rahoitusjärjestelmän kehitykseen liittyvät kysymykset. Hän työskenteli BOFITissa vierailevana tutkijana keväällä 2006.
Suomen Pankin siirtymätalouksien tutkimuslaitos (BOFIT)